R语言优雅的把数据基线表（表一）导出到word

基线表（Baseline Table）是医学研究中常用的一种数据表格，用于在研究开始时呈现参与者的初始特征和状态。这些特征通常包括人口统计学数据、健康状况和疾病史、临床指标、实验室检测、生活方式、社会经济等。

本人在既往文章《scitb包1.6版本发布，一个为制作专业统计表格而生的R包》发布乐我自己编写的scitb包，可以一键生成基线表，但是还是需要手动导入word，还是不是很方便，本期介绍怎么把基线表直接导入word。

首先咱们使用scitb包来生成一个基线表，先导入R包和数据，scitb包自带有我既往的早产数据，咱们直接从包调用

library(scitb)
bc<-prematurity

这是一个关于早产低体重儿的数据，低于2500g被认为是低体重儿。数据解释如下：low 是否是小于2500g早产低体重儿，age 母亲的年龄，lwt 末次月经体重，race 种族，smoke 孕期抽烟，ptl 早产史（计数），ht 有高血压病史，ui 子宫过敏，ftv 早孕时看医生的次数，bwt 新生儿体重数值

如何生成基线表可以看我既往的文章，这里就直接上代码了
假设咱们想race为研究目标，因为它是分类变量，咱们最好把它转成因子，因为scitb包有一定对数据类型的判定能力，如果你的分类变量类别大于5个，而你不转成因子的话，它可能自动判定为连续变量，处理方式不一样的，所以这里最好自己设定一下

bc$race<-as.factor(bc$race)

接下来就是定义全部变量，分类变量和分层变量，这和tableone包一模一样，如果你会使用tableone包，使用scitb包起来完全无压力。

allVars <-c("age", "lwt",  "smoke", "ptl", "ht", "ui", "ftv", "bwt")
fvars<-c("smoke","ht","ui")
strata<-"race"

一键生成统计结果

out<-scitb1(vars=allVars,fvars=fvars,strata=strata,data=bc)

接下咱们需要把这个表格导入到word里面，需要安装3个包，缺一不可，其实安装flextable包的话也会附带其他两个包安装

library(xtable)
library(flextable)
library(officer)

接下来咱们设置一下导出表格的位置

setwd("E:/公众号文章2024年/R语言优雅的把基线表导出到word")

接下来把out转成flextables格式

tb1<-as_flextable(xtable(out))

接下来咱们创建一个空的文档，后面可以向它写入数据

doc = read_docx()

咱们可以看到doc的路径在，这个是officer包的默认位置

接下来咱们把刚才的tb1添加入空的doc就可以啦

doc = body_add_flextable(doc,tb1)

最后还需对生成的doc进行打印，然后在默认的位置下就可以看到word了

print(doc,"./tb1.docx")

咱们打开看一下，还不是还不是很满意，删除第一列

这样就基本差不多啦

还可以按住表格根据内容自动调整，最后在修饰一下就好啦

将来在新版的scitb包将会添加这个一键导出到word的功能。