Package rgbif version 3.7.8
Parameters
name_backbone(
name,
rank = NULL,
kingdom = NULL,
phylum = NULL,
class = NULL,
order = NULL,
family = NULL,
genus = NULL,
strict = FALSE,
verbose = FALSE,
start = NULL,
limit = 100,
curlopts = list()
)
name_backbone_verbose(
name,
rank = NULL,
kingdom = NULL,
phylum = NULL,
class = NULL,
order = NULL,
family = NULL,
genus = NULL,
strict = FALSE,
start = NULL,
limit = 100,
curlopts = list()
)参数【name】：(字符）可能带有作者姓名的学名全称（必填）。
参数【rank】：(字符）作为等级枚举给出的等级。可选。
参数【kingdom】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【phylum】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【class】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【order】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【family】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【genus】：(字符）如果提供，默认情况下，如果没有找到与名称直接匹配的匹配项，也会尝试与此匹配。可选。
参数【strict】：(逻辑）如果为 TRUE，则（模糊）只匹配给定名称，但绝不匹配上层分类中的分类群（可选）。
参数【verbose】：(逻辑），该函数是否会返回更多（更不可靠）的结果。参见函数 name_backbone_verbose()。
参数【start】：开始的记录编号。默认值：0，与参数【limit】结合使用可翻阅结果。
参数【limit】：要返回的记录数。默认值：100。最大值 1000。
参数【curlopts】：传递给 HttpClient 的指定 curl 选项的列表。请参阅 curl::curl_options 了解 curl 选项。
如果没有匹配到结果，GBIF 会返回一个 data.frame，其中包含 synonym、confidence 和 matchType='NONE' 三列。
Value
对于 name_backbone，是一个包含多列的单一分类群的 data.frame。
对于 name_backbone_verbose，data.frame 中的模糊匹配结果数量较多。
您还将以 input_name、input_rank、input_kingdom 等列的形式获得输入的参数【name】、参数【rank】、参数【kingdom】、参数【phylum】等信息。
Examples
> name_backbone(name='Helianthus annuus', kingdom='plants')
# A tibble: 1 × 24
usageKey scientificName canonicalName rank status confidence matchType kingdom
* <int> <chr> <chr> <chr> <chr> <int> <chr> <chr>
1 9206251 Helianthus ann… Helianthus a… SPEC… ACCEP… 100 EXACT Plantae
# ℹ 16 more variables: phylum <chr>, order <chr>, family <chr>, genus <chr>,
# species <chr>, kingdomKey <int>, phylumKey <int>, classKey <int>,
# orderKey <int>, familyKey <int>, genusKey <int>, speciesKey <int>,
# synonym <lgl>, class <chr>, verbatim_name <chr>, verbatim_kingdom <chr>
> name_backbone(name='Helianthus', rank='genus', kingdom='plants')
# A tibble: 1 × 23
usageKey scientificName canonicalName rank status confidence matchType kingdom
* <int> <chr> <chr> <chr> <chr> <int> <chr> <chr>
1 3119134 Helianthus L. Helianthus GENUS ACCEPT… 98 EXACT Plantae
# ℹ 15 more variables: phylum <chr>, order <chr>, family <chr>, genus <chr>,
# kingdomKey <int>, phylumKey <int>, classKey <int>, orderKey <int>,
# familyKey <int>, genusKey <int>, synonym <lgl>, class <chr>,
# verbatim_name <chr>, verbatim_rank <chr>, verbatim_kingdom <chr>
> name_backbone(name='Poa', rank='genus', family='Poaceae')
# A tibble: 1 × 23
usageKey scientificName canonicalName rank status confidence matchType kingdom
* <int> <chr> <chr> <chr> <chr> <int> <chr> <chr>
1 2704173 Poa L. Poa GENUS ACCEPT… 100 EXACT Plantae
# ℹ 15 more variables: phylum <chr>, order <chr>, family <chr>, genus <chr>,
# kingdomKey <int>, phylumKey <int>, classKey <int>, orderKey <int>,
# familyKey <int>, genusKey <int>, synonym <lgl>, class <chr>,
# verbatim_name <chr>, verbatim_rank <chr>, verbatim_family <chr>
